U cilju unapređenja suradnje u područjima zaštite sigurnosti, teritorijalnog integriteta Bosne i Hercegovine i borbi protiv svih oblika teškog kriminaliteta u lipnju 2005. godine, zaključen je „Sporazum o koordinaciji rada institucija iz oblasti obavještajnih, sigurnosnih i policijskih aktivnosti (Ministarstvo obrane BiH, Minstarstvo sigurnosti BiH, Državna agencija za istrage i zaštitu, DGS, OSA, Uprava za neizravno oporezivanje BiH, Ministarstvo unutarnjih poslova FBiH, Ministarstvo unutarnjih poslova RS, Šef policije Brčko Distrikta, Šef financijske policije FBiH, Direktor Poreske uprave RS, Direktor Poreske uprave FBiH i Tužiteljstvo Bosne i Hercegovine), koje ima savjetodavnu ulogu.

Sustav za potporu kaznenim  istragama, osobito u oblasti povreda međunarodnog humanitarnog prava, unaprijeđen je potpisivanjem „Memoranduma o suradnji“, u listopadu mjesecu 2005. godine, između Tužiteljstva Bosne i Hercegovine i Državne agencije za istrage i zaštitu (SIPA)“.

Memorandum o razumjevanju sa SIPA-om

Uputstvo o profesionalnoj saradnji sa SIPA-om